Desde el ciclo escolar 2015-2016, el Instituto Militarizado del Sureste ofrece a los padres de familia su servicio de internado, dirigido a jóvenes varones de entre 11 y 18 años, que se encuentren cursando o estén por cursar el nivel escolar de secundaria o preparatoria y que desean fomentar sus valores con base en el respeto y la disciplina, todo ello con actividades complementarias dentro de sus instalaciones.

La educación que se brinda en el Internado provee diversas ventajas sobre el sistema de enseñanza tradicional: Se desarrollan competencias sociales mediante la convivencia diaria con los compañeros y mandos, se obtienen valores como el respeto, la tolerancia y responsabilidad, se fomenta la confianza en uno mismo, por lo que al final el interno aprende a lograr sus objetivos, obteniendo experiencias significativas y madurez, dentro de un ambiente de familia.